乾貨:細胞系十大常見問題及解析

細胞系(cell line)指原代細胞培養物經首次傳代成功後所繁殖的細胞群體。 也指可長期連續傳代的培養細胞。(由此便引申出了後來的有限細胞系(FiniteCellLine)、無限細胞系(InfiniteCellLine)),因此,細胞系狹義的是指可連續傳代的細胞(特定環境下口語和書面語都使用),廣義是指可傳代的細胞。

在做細胞系實驗時,經常遇到的問題今天小編就給大家整理出來了,收下這份乾貨,從實驗小白到大神您只需一步!

一、如何根據 STR 資料判斷細胞系的身份?

收到細胞系鑑定結果以及 STR 資訊,可以與參考資料庫進行比對。如果細胞樣本的每個 STR 位點和參考細胞 STR 位點都能重合匹配,即說明該細胞系正確,反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記,交叉汙染或發生遺傳不穩定。一般說來,匹配度≥80%即可認為該細胞系正確,匹配度<80%則說明該細胞系的來源需要被懷疑。

如果細胞系被鑑定出發生交叉汙染或錯誤標記,則需要拿更早代數的細胞進行鑑定,從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構購買一株新的細胞系。

二、如果細胞系沒有在資料庫中比對出結果怎麼辦?

如果已知資料庫中沒有找到你的細胞資訊,你可以用自己的細胞遺傳資訊建立自己的遺傳特性,以便後期進行自己細胞庫的比對。

三、細胞系交叉汙染或錯誤鑑定對研究是否有影響

答案是肯定的。使用錯誤的細胞系或者是被汙染的細胞系做研究,只會造成時間,金錢和精力的損失,以及造成實驗結果的不一致和不可重複。因此如果用被汙染或錯誤的細胞系做研究,在發表文章或做進一步研究時極有可能需要用正確的細胞再重複實驗。

四、全球因為細胞系用錯浪費了多少錢?

據不完全統計,僅就 HEp-2 與 Int-407 這兩株細胞(它們實際上是 Hela), 直接浪費的投入是 7 億美金,間接浪費了 7 億美金。

五、因為用錯細胞,產生了多少垃圾文章?

據不完全統計,僅就 HEp-2 與 Int-407 這兩株細胞(它們實際上是 Hela), 前者發表了近 6000 篇 SCI(17 萬次引用),後者發表了近 1400 篇 SCI。

乾貨:細胞系十大常見問題及解析

六、用錯細胞時間最長的持續了多少時間?

瑞典有一個科學家,在三十年的時間裡都以為自己的細胞是正確的,直到做了細胞鑑定之後發現是錯誤的。越早發現錯誤越好,鑑定之後是正確的話,自己也放心。

七、為什麼報告內最終結論,會出現匹配不上任何已知資料情況?

最大的可能性是因為這株細胞的標準序列並沒有收錄在國際的細胞庫之中,導致送檢樣本與任何的序列都不匹。出現這種情況大多數是因為該細胞系,可能是由國內課題組自主建系的。

八、國內有類似的 STR 標準資料庫嗎?

是有的,這個是協和醫院官方建立的一個國家實驗細胞資源共享平臺,http://www。cellresource。cn / 在裡面會收錄一些國內自主建系的細胞的標準序列。

九、對於 STR 位點引物設計有什麼要求嗎?

設計其實很簡單,並且很容易使用。但是由於這個位點的選擇和最佳化是非常枯燥並且耗時耗力的工作,建議由專業的服務方進行設計和合成。

十、除了檢測人源的細胞株,還可以檢測其他動物的細胞或者原代細胞嗎?

技術上是可以檢測的。但是鼠源細胞在結果上跟人源細胞有明顯的區別。鼠源一個 STR 位點會出現上百個重複,只能證明待測樣本不是人源的樣本。但是屬於小鼠的具體哪一種細胞株,無法確定,因此也不能排除鼠源細胞之間出現交叉汙染的可能。

至於人的原代細胞,由於國際上的資料庫裡面沒有收錄原代細胞標準序列,最終的檢測結果也是匹配不上任何的已知序列的。