一直神神叨叨的艾克西夫星人同樣想要消滅哥斯拉，他們完全信奉他們的“神明”，認為只有祂才能消滅地球進化的終極產物...

因為基多拉來自其他宇宙，所以哥斯拉所在宇宙的物理法則無法約束基多拉，導致哥斯拉在前期的戰鬥中無法對基多拉進行攻擊，而基多拉卻源源不斷的吸收哥斯拉體內的電磁能量和熱能，最後晴生將梅特菲斯與基多拉之間的連線打破，從而使這個宇宙的法則可以約束基多...

因為馬丁決定利用機械哥斯拉城的殘骸，再一次讓人類步入科技社會，而晴生害怕人類文明再經歷一次被毀滅的輪迴，遂丟下了老婆孩子，帶著昏迷不醒的優子，駕駛著最後的座機，衝向哥斯拉，最搞笑的是居然還同歸於盡了...

晴生在新人類女友召喚出的魔斯拉的幫助下清醒過來，破除了外星人對他的意識控制，從而切斷了基多拉和地球的聯絡，讓哥斯拉消滅了部分基多拉，從而挽救了地球的全部毀滅...

艾克西夫人，畢魯薩多人，人類三個人形種族合力但還是沒能打敗哥斯拉，各大要塞城市被擊破，畢魯薩多人的殺手鐧“機械哥斯拉計劃”也失敗，人們陷入絕望，經過人類高層的深思熟慮，決定三個種族的倖存者搭乘恆星間移民船“阿拉特拉姆號”前往塔e星...

利用機械哥斯拉建造的城市系統，晴生他們終於聯絡上了太空飛船...

針對於這種現象，目前應該有兩個原因，首先是出於對於自己的戰友們的愧疚，大家都死了，他作為領導者是內心有愧疚的，但這個說法並不足以說明問題，我認為主要還是因為要延續人類未來，從而也過去文明的決裂，男主等人的逝去，與新女友腹中的嬰兒，也恰恰代表...

在確認塔e星不適合人類生存，高層決定用晴生設計的作戰方案去打敗哥斯拉，重新奪回地球...