醫學文獻檢索中的基本概念

文獻檢索是醫學科研中必不可少的重要環節,如何充分利用各種資料庫進行文獻檢索是每個醫學研究人員要面對和解決的問題。但是對於某些剛剛接觸科研的小夥伴來說,對文獻檢索可能還是一頭霧水,無從下手,或者說只停留在對資料庫進行一些簡單的檢索。那麼如何才能充分挖掘海量醫學資料這座金山呢?工欲善其事,必先利其器。一些文獻檢索的基本概念還是需要了解的,下面我們就一起來認識一下它們吧。

檢索詞

顧名思義,檢索詞就是在檢索的時候輸入到檢索框裡的那個詞,它能夠概括你想要檢索的內容。在科研工作中,檢索詞基本來源於你要研究的內容,比如奧美拉唑治療上消化道出血的臨床療效,那麼,奧美拉唑和上消化道出血就是最主要的檢索詞。當然除了這兩個主角以外,我們還可以對其他一些限定條件進行檢索,比如限定某種研究設計型別,常見的有隨機對照試驗、Meta分析等等,還有一些結果評價指標,比如出血量、凝血時間等等。只要是課題涉及的,你關注的、想知道的,都可以作為檢索詞。

主題詞和自由詞

接觸過醫學文獻檢索的小夥伴可能會見過一個詞——MeSH。那麼什麼是MeSH呢?它其實就是主題詞。

主題詞

是資料庫官方指定的檢索詞,它是為了方便檢索,由資料庫官方給文獻加的標籤。在PubMed資料庫,主題詞是MeSH,在Embase資料庫,主題詞是Emtree。除了主題詞以外,主題詞的同義詞、近義詞、縮寫或者其他代用形式等都是

自由詞

。在進行文獻檢索的時候,應該結合主題詞和自由詞進行檢索,以確保把我們需要的文獻查全。

醫學文獻檢索中的基本概念

主題詞和檢索詞

是不是很簡單呢?舉個例子來進一步理解下吧!

我們以卒中(stroke)一詞為例,查詢它在PubMed中的主題詞和自由詞。具體怎麼查呢?第一步,開啟NCBI的網址連結

https://www。ncbi。nlm。nih。gov/

,在首頁上方的下拉選單裡選擇MeSH詞檢索入口,如下圖。

醫學文獻檢索中的基本概念

MeSH檢索入口

第二步,在檢索框裡輸入檢索詞“stroke”,找到該詞的MeSH,點選進入該詞條。如下圖。

醫學文獻檢索中的基本概念

如何找到MeSH

醫學文獻檢索中的基本概念

MeSH頁面

在主題詞介面,我們可以看到這個主題詞下的副主題詞和自由詞,並可以點選“Add to search builder”對主題詞進行檢索。

檢索欄位

檢索欄位,實際上就是不同的檢索點。一篇文獻可以拆分出很多不同的點,比如作者、發表年份、期刊、題目、摘要、關鍵詞、全文等等,這些就是檢索欄位,透過在資料庫中對欄位的限定,可以從海量文獻中搜到相關性高的文獻,縮小檢出結果的範圍。這樣,就讓我們離需要的文獻更進了一步。下圖中標出的是PubMed中部分檢索欄位,在這裡我們可以限定檢索詞出現的位置。

醫學文獻檢索中的基本概念

檢索欄位

下面就是PubMed資料庫中部分檢索欄位舉例,讓我們簡單瞭解一下它們都是做什麼的吧!

醫學文獻檢索中的基本概念

PubMed檢索欄位

邏輯運算子

這裡介紹文獻檢索的三種基本運算:AND、OR、NOT。是不是很像高中數學概念呢,結合下圖其實理解起來非常直觀形象呢。

醫學文獻檢索中的基本概念

邏輯運算子的三種關係

AND表示交集,即檢索詞與檢索詞之間是“和”的關係,不管所輸入的兩個檢索詞語所出現的位置在哪,只要它們同時出現在一篇文獻裡,這篇文獻就會被檢索出來。比如前面提到的用奧美拉唑治療消化道出血,在文獻檢索時可以寫成“奧美拉唑 AND 消化道出血”。

OR表示合集,即檢索詞與檢索詞之間是“或”的關係,說明檢索出來的文獻中至少包含其中一個檢索詞,比如檢索時可以用“OR”將主題詞和自由詞連線起來,來保證我們的檢索詞是全面的。

NOT表示差集,可以在檢索範圍內將某些不需要的部分排除。A NOT B,表示檢索包含有A詞的文獻並從中排除帶有B詞的文獻。比如雞蛋 NOT 臭雞蛋,表示在挑選出的雞蛋中把臭雞蛋剔除出去。

以上簡單介紹了醫學文獻檢索中一些基本的概念,雖然淺顯,但卻是構成檢索策略的基本要素,小夥伴們在認識了這些概念之後,就可以試著運用高階檢索進行文獻檢索了,是不是比想象中簡單了許多呢?

最後留給大家一個作業,每個人想一個題目,列出你們的檢索詞,然後等待小諾的抽查吧~

AND表示交集,即檢索詞與檢索詞之間是“和”的關係,不管所輸入的兩個檢索詞語所出現的位置在哪,只要它們同時出現在一篇文獻裡,這篇文獻就會被檢索出來。比如前面提到的用奧美拉唑治療消化道出血,在文獻檢索時可以寫成“奧美拉唑 AND 消化道出血”。

OR表示合集,即檢索詞與檢索詞之間是“或”的關係,說明檢索出來的文獻中至少包含其中一個檢索詞,比如檢索時可以用“OR”將主題詞和自由詞連線起來,來保證我們的檢索詞是全面的。

NOT表示差集,可以在檢索範圍內將某些不需要的部分排除。A NOT B,表示檢索包含有A詞的文獻並從中排除帶有B詞的文獻。比如雞蛋 NOT 臭雞蛋,表示在挑選出的雞蛋中把臭雞蛋剔除出去。

以上簡單介紹了醫學文獻檢索中一些基本的概念,雖然淺顯,但卻是構成檢索策略的基本要素,小夥伴們在認識了這些概念之後,就可以試著運用高階檢索進行文獻檢索了,是不是比想象中簡單了許多呢?

最後留給大家一個作業,每個人想一個題目,列出你們的檢索詞,然後等待小諾的抽查吧~

醫學文獻檢索中的基本概念