Cochrane 系統評價檢索策略制定之PubMed

編者按:

meta分析入門至關重要的一個技能便是檢索技巧。

按約定,科研君在獲得重慶醫科大學附屬第二醫院肝膽外科的程瑤、龔建平兩位老師的授權後,分享他們的檢索技巧心得三部曲之一——透過

例項講解 Cochrane 系統評價 PubMed 資料庫檢索策略的制定過程。

測試環境:

採用 Cochrane 肝膽組的系統評價檢索策略,文章題目是 Robot assistant for laparoscopic cholecystectomy (Review),並將檢索範圍限定為只納入 RCT 類文章。

Cochrane 系統評價檢索策略制定之PubMed

第一次看這種檢索策略頭暈是很正常的,下面請聽分解。

檢索策略框架解構

PICOS 是指 Patients(研究物件),Intervention(干預措施),Compare(比較),Outcome(結局),Study Design(設計型別),常用來制定檢索策略。但是一般只用到其中的 PIS。

P就是 Participants 或者 Patients。

我搜索的這篇是機器手輔助用於腹腔鏡膽囊切除術。那麼 P 就是做腹腔鏡膽囊切除術的患者。下面劃橫線的地方,就是 P。

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I就是 Intervention。

本例的干預措施是機器手輔助,下面劃橫線的地方,就是 I。

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S就是 Study Design。

這篇文章的檢索範圍限定在 RCTs 中

,所以要用到篩查 RCTs 的過濾器(search filter),請看下面劃橫線部分就是 S。

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看了分析後,我們不經要問,大牛能做出這個來,但對我這個初學者,怎麼做得出這麼複雜的檢索策略呢?其實不難,我們再細細分解。

策略詳拆之P

細解自由詞、關鍵詞 、主題詞

分解 P((laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*)AND (cholecystectom*)) OR cholecystectomy, laparoscopic[MeSH])。

上述是怎麼來的呢?首先講講自由詞、關鍵詞 、主題詞 [MeSH]。

laparoscop*這種就是自由詞,後面沒有加限制,*是後面跟隨意字母的意思。 cholecystectomy[tiab] 這種就是關鍵詞,[tiab] 是 title 和 abstract 的縮寫,表示 cholecystectomy 要在標題和摘要裡有。cholecystectomy, laparoscopic[MeSH] 就是主題詞,主題詞是 PubMed 的專家給每篇文章標記的。

系統評價就是要集合目前世界上所有相關證據,查得越全越好。用關鍵詞檢索,查全的敏感性高,但是要犧牲特異性,會導致查得結果太多,以後篩查工作量會非常大。主題詞就是起協調作用,更容易查全查準,主題詞這麼好,那大牛為什麼還要用自由詞呢?

原因有二:

(1)PubMed 專家也可能犯錯誤,主題詞標記錯誤。

(2)新的文章專家來不及標主題詞。比如下面兩篇文章,一篇有主題詞,另一篇很新就無主題詞

Cochrane 系統評價檢索策略制定之PubMed

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所以 Cochrane 制定的系統評價一般都是主題詞+自由詞,或者主題詞+關鍵詞。後者彌補前者的兩個弱點。

本例的 cholecystectomy, laparoscopic[MeSH] 是主題詞,(laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*) AND (cholecystectom*) 是自由詞組合。

那麼初學者怎麼想的到這麼複雜的檢索式,比如我怎麼知道 cholecystectomy, laparoscopic[MeSH] 是主題詞,怎麼來的?(laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*) 這一串這麼複雜,打死我也想不出來。

尋找主題詞

先講 cholecystectomy, laparoscopic[MeSH] 是主題詞是怎麼來的。在 PubMed 裡面以 laparoscopic cholecystectomy 檢索進入,你就會發現,最近新發的文章都沒有 MeSH。那我們就之前的文章來看,來研究一下,專家標的 MeSH。

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下面是隨意找的兩篇文章的 MeSH,一起來研究共同點。發現 MeSH Terms 裡面都有 cholecystectomy, laparoscopic,我們在後面加一個 [MeSH] 特指一下就行了。cholecystectomy, laparoscopic[MeSH] 怎麼來的就一目瞭然了。

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尋找自由詞

(laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*) AND (cholecystectom*) 這一串怎麼來的,這是玩文字遊戲,同義詞替換而已。laparoscopy OR coelioscopy OR celioscopy OR peritoneoscopy,你翻翻字典就知道它們是近義詞。為什麼要加星號*,laparoscop*= laparoscopy+laparoscopies……

假如你是新手,找不到全這些近義詞,那你可以下載 Cochrane 文章下來看。比如想寫腹腔鏡膽囊切除術的文章,那就直接用大牛制定好的來用就是了。假如你要寫其他方面的文章,比如 HIV,可以在 Cochrane library 上搜索相應文章,來找這些含義相近的同義詞。

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策略詳拆之I

下面這一串「Robotics」[MeSH] OR「remote operations」OR telerobotics OR「robot-assisted」OR「robot assisted」OR robotics 怎麼來的?「Robotics」[MeSH] 就是主題詞,用剛才的方法可以找得到,見下圖。

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「remote operations」OR telerobotics OR「robot-assisted」OR「robot assisted」OR robotics 這串自由詞組合怎麼來的?

我們同樣可以透過檢索以前的文章,參考別人使用的自由詞,拿過來直接用就可以了。

策略詳拆之S

(((randomized controlled trial [pt] OR controlled clinical trial [pt] OR randomized controlled trials [mh] OR random allocation [mh] OR double-blind method [mh] OR single-blind method [mh] OR clinical trial [pt] OR clinical trials [mh] OR (「clinical trial」[tw]) OR ((singl* [tw] OR doubl* [tw] OR trebl* [tw] OR tripl* [tw])

AND(mask* [tw] OR blind* [tw])) OR (placebos [mh] OR placebo* [tw] OR random* [tw] OR research design [mh:noexp])NOT (animals [mh] NOT human [mh]))))。

這個和 PubMed 的 RCTs 過濾器(下圖)表示的含義一樣

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檢索式 8 是指所有的 RCT 試驗,9 是動物實驗,最後 8 和 9 用 NOT 連在一起,就是除去所有動物實驗的 RCT。

如果需要篩選 RCT 文章,把下面這段話直接 COPY 到你的檢索策略最後加 AND 就行了 :(randomized controlled trial [pt] OR controlled clinical trial [pt] OR randomized [tiab] OR placebo [tiab] OR clinical trials as topic [mesh: noexp] OR randomly [tiab] OR trial [ti]) NOT (animals [mh] NOT humans [mh])。

實際上現在很多常用資料庫都可以在檢索中直接點選按鈕,將檢索範圍限制為 RCT,有關人的研究,英語文章等。

PIS檢索策略再回顧

P:(((laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*) AND (cholecystectom*)) OR cholecystectomy, laparoscopic[MeSH])

I:(「Robotics」[MeSH] OR「remote operations」OR telerobotics OR「robot-assisted」OR「robot assisted」OR robotics)

S:(randomized controlled trial [pt] OR controlled clinical trial [pt] OR randomized [tiab] OR placebo [tiab] OR clinical trials as topic [mesh: noexp] OR randomly [tiab] OR trial [ti]) NOT (animals [mh] NOT humans [mh])

最後 P AND I AND S:

(((laparoscop* OR coelioscop* OR celioscop* OR peritoneoscop*) AND (cholecystectom*)) OR cholecystectomy, laparoscopic[MeSH]) AND (「Robotics」[MeSH] OR「remote operations」OR telerobotics OR「robot-assisted」

OR「robot assisted」OR robotics) AND (randomized controlled trial [pt] OR controlled clinical trial [pt] OR randomized [tiab] OR placebo [tiab] OR clinical trials as topic [mesh: noexp] OR randomly [tiab] OR trial [ti]) NOT (animals [mh] NOT humans [mh])

最後放到 PubMed 裡面檢驗如下圖:這篇 Cochrane 的四篇 RCTs 都包含在內。

Cochrane 系統評價檢索策略制定之PubMed

大功告成,希望你有所收穫,到科研論文時間(dxypaper)給我們個大拇指,

下回接著分解檢索技巧之 The Cochrane Library。

編輯:任悠悠

題圖:shutterstock