西北農林科技大學發表紅星蘋果高質量基因組並解析其著色型芽變體細胞變異特徵與機制

芽變

通常可以產生具有經濟價值的新性狀，同時保留母株的優良性狀。芽變選種成為蘋果、柑橘等重要果樹品種遺傳改良的重要途徑。我國是世界

蘋果

生產和消費第一大國，在近40年的育種程序中，約32%的蘋果品種透過芽變選育而來，主要包括富士系、紅星

第一大

迄今為止，已在柑橘、桃、葡萄等多年生果樹中對體細胞變異進行了分析，但蘋果中對體細胞變異的相關認識尚十分有限。

系和嘎啦系的著色、早熟等性狀的芽變品種逾100個。芽變通常是由芽分生組織發生的體細胞變異引起。在植物發育過程中，體細胞變異的不斷積累可能影響了芽變的發生。

上線了（Advance Access）

近日，Horticulture Research

合作完成的題為

近日，

Horticulture Research

西北農林科技大學聯合紐西蘭皇家植物與食品研究院

Multi-omics analyses reveal MdMYB10 hypermethylation being responsible for a bud sport of apple fruit color

Multi-omics analyses reveal MdMYB10 hypermethylation being responsible for a bud sport of apple fruit color

的研究論文。該研究

的研究論文。

該研究

構建紅星蘋果高質量基因組並解析其著色型芽變體細胞變異特徵與機制。

構建紅星蘋果高質量基因組並解析其著色型芽變體細胞變異特徵與機制。

前期發現深紅著色紅星系蘋果品種‘俄矮2號’的1個分枝結出綠色至淡紅色果實，透過形態學鑑定、DNA鑑定和嫁接試驗確認其為芽變。隨著果實發育，芽變枝與原始枝結出果實的果皮中總花青素含量不斷升高，同時在各發育時期均存在顯著差異

（圖1）

圖 1 多組學分析揭示‘俄矮2號’蘋果著色型芽變發生源於MdMYB10超甲基化

。隨後，本研究利用基因組測序技術對‘俄矮2號’的基因組進行了從頭組裝，獲得了高質量基因組，BUSCO評估完整度為97.1%。基於該基因組，作者對‘俄矮2號’分枝發育過程中的體細胞變異進行了分析，評估其體細胞突變率為4.56×10

每年每鹼基，進一步分析確認了芽變枝與原始枝之間存在253個SNP、118個InDel及1個SV

基於以上結果，

（圖1）

論文連結：

https：//academic。oup。com/hr/advance-article/doi/10。1093/hr/uhac179/6674672？login=false